EAV-HP在SLCO1B3基因5’端非编码区整合影响芦花鸡肝脏代谢组学研究

doi:10.11843/j.issn.0366-6964.2026.01.042

畜牧兽医学报 ›› 2026, Vol. 57 ›› Issue (1): 476-485.doi: 10.11843/j.issn.0366-6964.2026.01.042

EAV-HP在SLCO1B3基因5’端非编码区整合影响芦花鸡肝脏代谢组学研究

王雅君¹^,²^,³^,⁴(), 刘奇¹^,²^,³, 王扬扬¹^,²^,³, 何雷¹^,²^,³, 魏颖¹^,²^,³, 陈松彪¹^,²^,³, 余祖华¹^,²^,³, 丁轲¹^,²^,³(), 陈建¹^,²^,³()

^1.河南科技大学动物科技学院功能微生物与畜禽健康实验室，洛阳 471003
^2.洛阳市活载体生物材料与动物疫病防控重点实验室，洛阳 471003
^3.河南科技大学动物疫病与公共卫生重点实验室，洛阳 471003
^4.河南科技大学化学与化工学院，洛阳 471003

收稿日期:2025-05-22 出版日期:2026-01-23 发布日期:2026-01-26
通讯作者: 丁轲,陈建 E-mail:670822426@qq.com;keding19@163.com;Chenillejian@ 163.com;Chenillejian@163.com
作者简介:王雅君，硕士，主要从事家禽病毒感染机制研究，E-mail：670822426@qq.com
基金资助:
国家自然科学基金(32302908)

Study on the Effect of EAV-HP Integration in the 5’ Non-Coding Region of the SLCO1B3 Gene on the Liver Metabolomics of Luhua Chicken

WANG Yajun¹^,²^,³^,⁴(), LIU Qi¹^,²^,³, WANG Yangyang¹^,²^,³, HE Lei¹^,²^,³, WEI Ying¹^,²^,³, CHEN Songbiao¹^,²^,³, YU Zuhua¹^,²^,³, DING Ke¹^,²^,³(), CHEN Jian¹^,²^,³()

^1.Laboratory of Functional Microbiology and Animal Health，College of Animal Science and Technology，Henan University of Science and Technology，Luoyang 471003，China
^2.Luoyang Key Laboratory of Live Carrier Biomaterial and Animal Disease Prevention and Control，Luoyang 471003，China
^3.The Key Laboratory of Animal Disease and Public Health，Henan University of Science and Technology，Luoyang 471003，China
^4.College of Chemistry and Chemical Engineering，Henan University of Science and Technology，Luoyang 471003，China

Received:2025-05-22 Online:2026-01-23 Published:2026-01-26
Contact: DING Ke, CHEN Jian E-mail:670822426@qq.com;keding19@163.com;Chenillejian@ 163.com;Chenillejian@163.com

摘要/Abstract

摘要：

鸡绿蛋壳特征的形成与内源性逆转录病毒EAV-HP启动蛋壳腺中溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员1B3（SLCO1B3）的高表达相关。作为代谢核心器官，鸡的肝脏中SLCO1B3高表达，但EAV-HP的插入突变下调鸡肝脏中SLCO1B3的表达，该过程中鸡肝脏的代谢组学研究未见报道。本研究以芦花鸡为研究对象，利用绿壳蛋判型引物确定38只芦花鸡中产绿壳蛋频率为47.4%；EAV-HP^+/+和EAV-HP^+/-整合均显著降低芦花鸡肝脏中SLCO1B3转录水平（P<0.05），尤其是EAV-HP^+/+整合影响效果更为显著；代谢组学共筛选到80个差异代谢物，其中上调30个，下调50个；代谢物所富集到的通路主要涉及牛磺酸和次牛磺酸代谢、柠檬酸循环（TCA循环）、碳水化合物代谢、醚脂质代谢及丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢等生物过程。研究结果揭示了EAV-HP插入突变所致的SLCO1B3表达下调对芦花鸡肝脏代谢物及代谢通路的影响，为充分了解和利用内源性逆转录病毒改善鸡群生产性能提供研究思路和方向。

关键词: EAV-HP, SLCO1B3, 代谢组学, 代谢物

Abstract:

The formation of green eggshell characteristics in chickens is associated with the high expression of Solute Carrier Organic Anion Transporter Family Member 1B3 （SLCO1B3） in eggshell glands initiated by the endogenous retrovirus EAV-HP. As a core metabolic organ， SLCO1B3 is highly expressed in the chicken liver. The insertion mutation of EAV-HP downregulates the expression of SLCO1B3 in the chicken liver. Metabolomics studies of chicken liver during this process have not been reported. This study took the Luhua chicken as the research object. Using the green-shelled egg genotypic primers， it was determined that the frequency of green-shelled eggs produced in 38 Luhua chickens was 47.4%. Both the integration of EAV-HP^+/+ and EAV-HP^+/- significantly reduced the transcriptional level of SLCO1B3 in the liver of Luhua chicken （P<0.05）， especially the effect of the integration of EAV-HP^+/+ was especially significant. A total of 80 differential metabolites were screened out by metabolomics， among which 30 were up-regulated and 50 were down-regulated. The pathways through which metabolites are enriched mainly involve biological processes such as taurine and hypotaurine metabolism， the citric acid cycle （TCA cycle）， carbohydrate metabolism， ether lipid metabolism and alanine， aspartic acid and glutamic acid metabolism. The research results revealed the effect of down-regulation of SLCO1B3 expression caused by EAV-HP insertion mutation on liver metabolites and metabolic pathways in chickens， providing research ideas and directions for fully understanding and utilizing endogenous retroviruses to improve the production performance of chicken flocks.

Key words: EAV-HP, SLCO1B3, metabolomics, metabolites

中图分类号:

S852.2

王雅君, 刘奇, 王扬扬, 何雷, 魏颖, 陈松彪, 余祖华, 丁轲, 陈建. EAV-HP在SLCO1B3基因5’端非编码区整合影响芦花鸡肝脏代谢组学研究[J]. 畜牧兽医学报, 2026, 57(1): 476-485.

WANG Yajun, LIU Qi, WANG Yangyang, HE Lei, WEI Ying, CHEN Songbiao, YU Zuhua, DING Ke, CHEN Jian. Study on the Effect of EAV-HP Integration in the 5’ Non-Coding Region of the SLCO1B3 Gene on the Liver Metabolomics of Luhua Chicken[J]. Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica, 2026, 57(1): 476-485.

图/表 8

表1

图1

表2

图2

表3

表4

图3

图4

参考文献 23

[1]	WANG Z，QU L，YAO J，et al.An EAV-HP insertion in 5′ flanking region of SLCO1B3 causes blue eggshell in the chicken［J］.PloS Gen，2013，9（1）：p.e1003183.
[2]	DALIRSEFAT S B，DONG X，DENG X，et al.Molecular phylogenetic analysis of Chinese indigenous blue-shelled chickens inferred from whole genomic region of the SLCO1B3 gene［J］.Poult Sci，2015，94（8）：1776-1786.
[3]	LI Z，REN T，LI W，et al.Association between the methylation statuses at CpG sites in the promoter region of the SLCO1B3，RNA expression and color change in blue eggshells in Lushi chickens［J］.Front Gen，2019.10：161.
[4]	周玉.卢氏绿壳蛋鸡蛋壳颜色变浅机制及调控技术研究［D］.郑州：河南农业大学，2017.
	ZHOU Y.Echanism and regulation technology for the color changeof Lushi Chicken green shell eggs［D］.Zhengzhou：Henan Agricultural University，2017.（in Chinese）
[5]	CHEN J，DALIRSEFAT S B，HAN D，et al.An EAV-HP insertion in the 5' flanking region of SLCO1B3 is associated with its tissue-expression profile in blue-eggshell Yimeng chickens （Gallus gallus）［J］.Poult Sci，2020； 99（12）：6371-6377.
[6]	SUN R，YING Y，TANG Z，et al.The emerging role of the SLCO1B3 protein in cancer resistance［J］.Protein Pept Lett，2020； 27（1）：17-29.
[7]	CHEN J，HUA G，HAN D，et al.An EAV-HP insertion in the promoter region of SLCO1B3 has pleiotropic effects on chicken liver metabolism based on the transcriptome and proteome analysis［J］.Sci Rep，2021，11（1）：7571.
[8]	TREFTS E，GANNON M，WASSERMAN D H.The liver［J］.Curr Biol，2017，27（21）：R1147-R1151.
[9]	ISHIHARA S.Detection of long terminal repeat loci derived from endogenous retrovirus in junglefowl using whole-genome sequencing［J］.Sci Rep，2023，13（1）：7380.
[10]	SACCO M A，HOWES K，SMITH L P，et al.Assessing the roles of endogenous retrovirus EAV-HP in avian leukosis virus subgroup J emergence and tolerance［J］.J Virol，2004，78（19）：10525-10535.
[11]	郭苗苗，杨理凯，杜伟立，等.CRISPR/Cas9介导的外源基因靶向插入鸡EAV-HP基因组［J］.生物工程学报，2019，35（2）：236-243.
	GUO M M，YANG L K，DU W L，et al.CRISPR/Cas9-mediated foreign gene targeted knock-in into the chicken EAV-HP genome［J］.Chinese Journal of Biotechnology，2019，35（2）：236-243.（in Chinese）
[12]	徐超.CRISPR/Cas9介导的表达EAV-HP Env细胞系与ALV-J Env重组禽腺病毒构建及其特性研究［D］.扬州：扬州大学，2024.
	XU C.Study on the characteristics of CRISPR/Cas9-Mediated cell line expressing EAV-HP env and recombinant fowl adenovirus expressing ALV-J env［D］.Yangzhou：Yangzhou University，2024. （in Chinese）
[13]	王晨，张丹萍，张浩，等.5个绿壳蛋鸡群体中EAV-HP在SLCO1B3基因5′-非编码区插入整合频率和类型的研究［J］.中国畜牧兽医，2014，41（10）：183-188.
	WANG C，ZHANG D P，ZHANG H，et al.Frequency and type of EAV-HP insertion in the 5'-flanking region of SLCO1B3 gene in five blue-egged chicken populations［J］.China Animal Husbandry ＆ Veterinary Medicine，2014，41（10）：183-188.（in Chinese）
[14]	张丹萍，蒋光海，廖恩俊，等.EAV-HP在两个绿壳蛋鸡群体中的插入整合研究［J］.四川畜牧兽医，2023，50（5）：30-31，36.
	ZHANG D P，JIANG G H，LIAO E J，et al.Insertion and integration study of EAV-HP in two green-shelled laying hen populations［J］.Sichuan Animal ＆ Veterinary Sciences，2023，50（5）：30-31，36.（in Chinese）
[15]	WANG J，LU X，ZHANG W，et al.Endogenous retroviruses in development and health［J］.Trends Microbiol，2024； 32（4）：342-354.
[16]	ZHU X，CHEN Y，LAN T，et al.Transcriptome analysis of healthy and fatty liver revealed that inhibition of SLCO1B3 induces abnormal liver metabolism and lipid synthesis［J］.Poult Sci，2023； 102（11）：103023.
[17]	孟祥旭，李佳，任德明，等.民猪猪繁殖与呼吸综合征恢复力高低组血清代谢组学研究［J］.畜牧兽医学报，2025，56（4）：1689-1699.
	MENG X X，LI J，REN D M，et al.Study on serum metabolomics of high and low resilience group of Min pigs with porcine reproductive and respiratory syndrome［J］.Acta Veterinaria et Zootechnica Sinca，2025，56（04）：1689-1699.（in Chinese）
[18]	朱靓芸，曾一桐，童庆芳，等.猪流行性腹泻病毒感染猪肾细胞的代谢组学研究［J］.中国兽医科学，2023，53（8）：1065-1072.
	ZHU L Y，ZENG Y T，TONG Q F，et al.Metabonomics of porcine kidney cells infected with porcine epidemic diarrhea virus［J］.Chinese Veterinary Science，2023，53（8）：1065-1072.（in Chinese）
[19]	RAFIEE Z，GARCÍA-SERRANO A M，DUARTE J M N.Taurine supplementation as a neuroprotective strategy upon brain dysfunction in metabolic syndrome and diabetes［J］.Nutrients，2022，14（6）：1292.
[20]	SANTULLI G，KANSAKAR U，VARZIDEH F，et al.Functional role of taurine in aging and cardiovascular health：An updated overview［J］.Nutrients，2023，15（19）：4236.
[21]	BASEGGIO CONRADO A，D'ANGELANTONIO M，D'ERME M，et al.The interaction of hypotaurine and other sulfinates with reactive oxygen and nitrogen species：a survey of reaction mechanisms［J］.Adv Exp Med Biol，2017，975（Pt1）：573-583.
[22]	CHOI I，SON H，BAEK J H.Tricarboxylic acid （TCA） cycle intermediates：Regulators of immune responses［J］.Life （Basel），2021，11（1）：69.
[23]	LING Z N，JIANG Y F，RU J N，et al.Amino acid metabolism in health and disease［J］.Signal Transduct Target Ther，2023； 8（1）：345.

引物名称 Primer name	引物序列（5′→3′） Sequence	产物长度/bp Product size
ISU	TGTAAGAAGGCAGAGGGTTGA	500，700
ISD	GGAAACGAGGTGTGTTGTAGG
IDD	AATCTTGTCTCCTCCCAGTTC
qSLCO1B3-F	TGGTGATTGCATTTGTAAGCTA	197
qSLCO1B3-R	TGGAGAGCAGGGATTTATGC	197
qGAPDH-F	GAACATCATCCCAGCGTCCA	112
qGAPDH-R	CGGCAGGTCAGGTCAACAAC	112

芦花鸡Luhua chicken	数量/只 Number	基因型数量/只（频率/%） Number of genotypes （frequency）			绿壳蛋频率/% Green shell egg frequency	基因频率/% Gene frequency
芦花鸡Luhua chicken	数量/只 Number	N/N	LC/N	LC/LC	绿壳蛋频率/% Green shell egg frequency	N	LC
粉壳蛋 Pink shell egg	18	15（83.3）	3（16.7）	0（0）	16.7	91.65	8.35
绿壳蛋 Green shell egg	20	5（25）	13（65）	2（10）	75	57.5	42.5
总计 Total	38	20（52.6）	16（42.1）	2（5.3）	47.4	73.65	26.35

分析类型 Analysis type	分析项目 Analysis project	R²X（cum）	R²Y（cum）	Q²（cum）
PLS-DA	阳离子 Cation	0.488	0.999	0.811
PLS-DA	阴离子 Anion	0.442	0.999	0.673
OPLS-DA	阳离子 Cation	0.488	0.999	0.659
OPLS-DA	阴离子 Anion	0.442	0.999	0.552

EAV-HP在SLCO1B3基因5’端非编码区整合影响芦花鸡肝脏代谢组学研究

Study on the Effect of EAV-HP Integration in the 5’ Non-Coding Region of the SLCO1B3 Gene on the Liver Metabolomics of Luhua Chicken

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

图/表 8

参考文献 23

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

[1]	朱春红, 陶志云, 耿明阳, 王志成, 宋卫涛, 顾昊天, 刘宏祥, 章双杰, 陈黎, 徐文娟, 王逸飞, 李慧芳. 鸭精液品质相关睾丸代谢物的差异分析[J]. 畜牧兽医学报, 2026, 57(1): 270-281.
[2]	郑浩, 罗芳, 宋承磊, 陶金忠. 基于代谢组学技术筛选人工授精后未妊娠奶牛血浆潜在生物标志物的研究[J]. 畜牧兽医学报, 2025, 56(7): 3252-3264.
[3]	孟祥旭, 李佳, 任德明, 陈奎蓉, 和艺云, 王立贤, 盛熙晖, 王立刚. 民猪猪繁殖与呼吸综合征恢复力高低组血清代谢组学研究[J]. 畜牧兽医学报, 2025, 56(4): 1689-1699.
[4]	王昕昕, 刘小英, 王宜, 王芳, 赵晗, 杜志强, 杨彩侠. 急性热应激通过降低牛磺酸水平影响猪睾丸支持细胞的功能[J]. 畜牧兽医学报, 2025, 56(4): 1779-1790.
[5]	龙怡舟, 娄文琦, 黄上真, 师睿, 陈功, 李斌, 次桑卓玛, 徐青, 王雅春. 基于血液代谢组筛选奶牛血氧饱和度相关代谢物及通路[J]. 畜牧兽医学报, 2025, 56(2): 621-632.
[6]	高志苗, 倪海花, 王彦平, 赵雪艳, 李菁璇, 王继英, 张勤. 代谢组学应用于猪重要经济性状遗传解析[J]. 畜牧兽医学报, 2025, 56(10): 4787-4795.
[7]	翁梓媛, 岑婷, 马也, 郑恩沛, 吴璇, 冷军, 王祖忠, 王媛媛, 叶子颖, 李敏虹, 胡长敏. 一款猫泌尿道处方罐功效评价及其尿液代谢组学分析[J]. 畜牧兽医学报, 2025, 56(10): 5289-5301.
[8]	史心琦, 马梦梦, 高腾云, 刘深贺. 动物肠道微生物调控精液品质的研究进展[J]. 畜牧兽医学报, 2025, 56(1): 26-35.
[9]	陈倩玲, 沙玉柱, 刘秀, 邵鹏阳, 王翻兄, 陈小伟, 杨文鑫, 谢转回, 高敏, 黄薇. 肠道微生物与线粒体互作调控动物脂肪沉积的研究进展[J]. 畜牧兽医学报, 2024, 55(6): 2293-2303.
[10]	王中波, 刘爽, 贺丽霞, 冯雪, 杨梦丽, 汪书哲, 刘源, 冯兰, 丁晓玲, 冀国尚, 杨润军, 张路培, 马云. 固原黄牛不同部位肌肉组织代谢组学分析[J]. 畜牧兽医学报, 2024, 55(4): 1565-1578.
[11]	李常营, 徐兰梦, 黄榆智, 何航, 万堃, 袁岩聪, 章杰. 哺乳方式对猪生长、血清生化、肠道微生物及代谢物的影响[J]. 畜牧兽医学报, 2024, 55(11): 5147-5158.
[12]	王瑞玲, 王雪妍, 王菲菲, 孔维怡, 毛永霞, 刘欣, 丁辉, 许立华, 郭延生. 奶牛产后急性子宫内膜炎血液氧化脂质组变化特征[J]. 畜牧兽医学报, 2024, 55(1): 373-387.
[13]	张兆博, 侯黎明, 李平华, 杜陶然, 王中宇, 吴承武, 黄瑞华. 基于血浆代谢组学筛选日粮纤维影响二花脸猪肉质性状的候选代谢物[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(9): 3758-3769.
[14]	王芮杰, 洪志楷, 董英娇, 陈瑶, 王晋宇, 王冠华. 基于UPLC-Q-TOF-MS/MS代谢组学研究土霉素和穿心莲内酯对鸡代谢的影响[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(7): 3078-3090.
[15]	曾成容, 王娜, 毕文文, 梅世慧, 何广霞, 张峻杰, 陈泽, 文明, 周碧君. A型产气荚膜梭菌感染鸭回肠代谢组学分析[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(6): 2555-2569.