14株北京地区犬细小病毒分离毒株的VP2、NS1基因序列分析

doi:10.11843/j.issn.0366-6964.2021.028

畜牧兽医学报 ›› 2021, Vol. 52 ›› Issue (1): 262-267.doi: 10.11843/j.issn.0366-6964.2021.028

14株北京地区犬细小病毒分离毒株的VP2、NS1基因序列分析

李少晗^1,2, 由欣月^1,2, 范君文³, 徐一⁴, 郝雲峰^1,2, 崔尚金^1,2, 秦彤^1,2*

1. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京 100193;
2. 兽用药物与兽医生物技术北京科学观测站, 北京 100193;
3. 北京市动物疫病预防控制中心, 北京 102629;
4. 中国动物疾病预防控制中心, 北京 100125

收稿日期:2020-06-22 出版日期:2021-01-23 发布日期:2021-01-19
通讯作者: 秦彤,主要从事动物传染病病原学与流行病学研究,E-mail:qintong@caas.cn
作者简介:李少晗(1996-),女,河北邢台人,硕士,主要从事动物传染病病原学与流行病学研究,E-mail:1037017995@qq.com
基金资助:
中国农业科学院科技创新工程项目（ASTIP-IAS15）

Sequence Analysis of the Complete VP2 and NS1 Genes of 14 Canine Parvovirus Isolates in Beijing

LI Shaohan^1,2, YOU Xinyue^1,2, FAN Junwen³, XU Yi⁴, HAO Yunfeng^1,2, CUI Shangjin^1,2, QIN Tong^1,2*

1. Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, China;
2. Scientific Observing and Experiment Station of Veterinary Drugs and Diagnostic Technology of Ministry of Agriculture, Beijing 100193, China;
3. Beijing Animal Disease Prevention and Control Center, Beijing 102629, China;
4. China Animal Diseases Control Center, Beijing 100125, China

Received:2020-06-22 Online:2021-01-23 Published:2021-01-19

摘要/Abstract

摘要： 从北京地区疑似细小病毒感染的犬粪拭子中成功分离鉴定出14株犬细小病毒（CPV）毒株，并对其完整的VP2和NS1基因进行了序列分析。结果表明，鉴定到的14株CPV毒株中，7株为New CPV-2a型，7株为CPV-2c型。此外，NS1的19、33、293、588、624和656位氨基酸以及VP2的13、574位氨基酸为新鉴定的氨基酸突变位点。基于VP2、NS1基因的系统进化分析表明，大部分的New CPV-2a型和CPV-2c型毒株与广西南宁和吉林长春地区的分离毒株亲缘关系密切，说明本次分离毒株与广西或吉林地区分离毒株具有相同的起源。本研究为更好地开展犬细小病毒流行病学调查提供了有益借鉴，也为深入研究犬细小病毒变异和传播的分子机制奠定了基础。

关键词: 犬细小病毒, 分离鉴定, VP2基因, NS1基因, 进化分析

Abstract: Fourteen strains of canine parvovirus (CPV) were successfully isolated and identified from feces swabs of dogs which were suspected to be infected CPV in Beijing, and their complete NS1 and VP2 genes were sequenced and analyzed. Among the 14 strains identified, the results showed that 7 strains were New CPV-2a and 7 strains were of CPV-2c. Besides, some new amino acid mutation sites were identified (amino acids 19, 33, 293, 588, 624 and 656 of the NS1 and amino acids 13 and 574 of the VP2). Phylogenetic analysis based on the VP2 and NS1 genes indicated that most of the New CPV-2a and CPV-2c strains were closely related to the isolated strains in Nanning, Guangxi, and Changchun, Jilin, indicating that the isolated strains had the same origin as the isolated strains in Guangxi or Jilin. This study provides a useful reference for better epidemiological investigation of canine parvovirus, and also builds a foundation for the in-depth study of the molecular mechanism of canine parvovirus variation and transmission.

Key words: canine parvovirus, isolation and identification, VP2 gene, NS1 gene, evolutionary analysis

中图分类号:

S852.659.2

李少晗, 由欣月, 范君文, 徐一, 郝雲峰, 崔尚金, 秦彤. 14株北京地区犬细小病毒分离毒株的VP2、NS1基因序列分析[J]. 畜牧兽医学报, 2021, 52(1): 262-267.

LI Shaohan, YOU Xinyue, FAN Junwen, XU Yi, HAO Yunfeng, CUI Shangjin, QIN Tong. Sequence Analysis of the Complete VP2 and NS1 Genes of 14 Canine Parvovirus Isolates in Beijing[J]. Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica, 2021, 52(1): 262-267.

参考文献 13

[1]	COTMORE S F, TATTERSALL P. The autonomously replicating parvoviruses of vertebrates[J]. Adv Virus Res, 1987, 33:91-174.
[2]	HUEFFER K, PARKER J S L, WEICHERT W S, et al. The natural host range shift and subsequent evolution of canine parvovirus resulted from virus-specific binding to the canine transferrin receptor[J]. J Virol, 2003, 77(3):1718-1726.
[3]	NELSON C D S, PALERMO L M, HAFENSTEIN S L, et al. Different mechanisms of antibody-mediated neutralization of parvoviruses revealed using the Fab fragments of monoclonal antibodies[J]. Virology, 2007, 361(2):283-293.
[4]	GILBERT L, VALILEHTO O, KIRJAVAINEN S, et al. Expression and subcellular targeting of canine parvovirus capsid proteins in baculovirus-transduced NLFK cells[J]. FEBS Lett, 2005, 579(2):385-392.
[5]	SAXENA L, KUMAR G R, SAXENA S, et al. Apoptosis induced by NS1 gene of Canine Parvovirus-2 is caspase dependent and p53 independent[J]. Virus Res, 2013, 173(2):426-430.
[6]	WANG H L, JIN H L, LI Q, et al. Isolation and sequence analysis of the complete NS1 and VP2 genes of canine parvovirus from domestic dogs in 2013 and 2014 in China[J]. Arch Virol, 2016, 161(2):385-393.
[7]	MARTELLA V, DECARO N, ELIA G, et al. Surveillance activity for canine parvovirus in Italy[J]. J Vet Med Ser B, 2005, 52(7-8):312-315.
[8]	OHSHIMA T, HISAKA M, KAWAKAMI K, et al. Chronological analysis of canine parvovirus type 2 isolates in Japan[J]. J Vet Med Sci, 2008, 70(8):769-775.
[9]	BUONAVOGLIA C, MARTELLA V, PRATELLI A, et al. Evidence for evolution of canine parvovirus type 2 in Italy[J]. J Gen Virol, 2001, 82(Pt 12):3021-3025.
[10]	BATTILANI M, MODUGNO F, MIRA F, et al. Molecular epidemiology of canine parvovirus type 2 in Italy from 1994 to 2017:recurrence of the CPV-2b variant[J]. BMC Vet Res, 2019, 15(1):393.
[11]	YI L, TONG M, CHENG Y, et al. Phylogenetic analysis of canine parvovirus VP2 gene in China[J]. Transbound Emerg Dis, 2016, 63(2):e262-e269.
[12]	PÉREZ R, CALLEROS L, MARANDINO A, et al. Phylogenetic and genome-wide deep-sequencing analyses of canine parvovirus reveal co-infection with field variants and emergence of a recent recombinant strain[J]. PLoS One, 2014, 9(11):e111779.
[13]	HORIUCHI M, GOTO H, ISHIGURO N, et al. Mapping of determinants of the host range for canine cells in the genome of canine parvovirus using canine parvovirus/mink enteritis virus chimeric viruses[J]. J Gen Virol, 1994, 75(Pt 6):1319-1328.

[1]	陈玥彤, 刘晓涵, 王芷洋, 赵宇馨, 周铁忠, 胡增金, 朱悦, 王少辉, 田明星, 丁思羽, 祁晶晶, 于圣青. 广东规模化鸡场死鸡胚中鸡毒支原体的分离鉴定、致病性及药物敏感性[J]. 畜牧兽医学报, 2024, 55(1): 290-299.
[2]	姜玲玲, 牛小霞, 刘强, 张刚, 王璞, 李勇. 宁夏地区肉牛腹泻相关病毒感染状况的分析[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(9): 3863-3871.
[3]	刘鑫欢, 恽佳蕾, 毛立, 李基棕, 郝飞, 何苗锋, 杨蕾蕾, 张纹纹, 程子龙, 孙敏, 刘茂军, 王少辉, 白娟, 李文良. 羊腹泻样本中大肠杆菌的分离、毒力基因与耐药性分析[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(8): 3445-3454.
[4]	陈宏建, 曹艳, 樊杰, 甘荣萱, 宋文博, 喻盛炜, 杨婷, 赵艳霞, 魏春燕, 谢锐, 华琳, 彭忠, 吴斌. 2020—2022年湖北省生猪屠宰场伪狂犬病病毒的分离鉴定及遗传进化分析[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(7): 2972-2981.
[5]	王佳丽, 周宁, 陈曦, 岳华, 汤承. 犬腺病毒2型E3基因自然缺失毒株的分离鉴定及其致病性[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(7): 2982-2990.
[6]	赵菲菲, 李杰, 韩宁, 谢仕廷, 曾振灵. 分离自屠宰场的肺炎克雷伯菌的耐药性分析[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(7): 3044-3053.
[7]	袁生, 李安琪, 吕文珂, 羊露露, 周峰, 黄良宗, 白挨泉, 温峰, 黄淑坚, 郭锦玥. 一株猪伪狂犬病病毒的主要毒力相关基因的变异分析及其对家兔的致病性[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(5): 2195-2199.
[8]	刘建奎, 徐叶, 刘辰, 于慧, 杨圆, 何乐, 李佳睿, 但惠娟, 戴爱玲, 杨小燕, 魏春华. 基于全基因组分析2017—2021年福建省猪繁殖与呼吸综合征病毒基因组特征[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(4): 1579-1589.
[9]	李晓涵, 杨伏春, 刘芮, 高立, 崔红玉, 张艳萍, 刘长军, 祁小乐, 王笑梅, 高玉龙, 李凯. 表达鸡传染性法氏囊病病毒VP2基因的重组火鸡疱疹病毒的构建及生物学特性分析[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(2): 656-662.
[10]	王梦娇, 蒋倩, 马学军, 夏瑞阳, 郭雪萍, 孙磊, 钟旗, 马雪连, 姚刚. 新疆地区牛冠状病毒的分子流行病学调查[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(12): 5125-5133.
[11]	张傲, 谭斌, 刘可欣, 刘佳利, 张淑琴. 一株H1N1亚型猪流感病毒全基因组特征分析[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(11): 4866-4871.
[12]	李畅, 周平, 温平, 杨克礼, 刘威, 郭锐, 刘泽文, 袁芳艳, 高婷, 宋浩菲, 田永祥, 周丹娜. 一株猪圆环病毒2d基因型毒株的全基因组序列及其衣壳蛋白的小鼠免疫原性分析[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(10): 4289-4299.
[13]	王萌, 张森豪, 张柳, 李佳璇, 王晓娜, 崔文, 姜艳平, 周晗, 王丽, 乔薪瑗, 李一经, 唐丽杰. 1株E亚群禽白血病病毒的分离鉴定及遗传进化分析[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(9): 3107-3120.
[14]	程宝钰, 李子荷, 崔燕蕾, 李嘉慧, 杨鑫玮, 于永乐, 杨海燕, 单虎, 张传美. 猫细小病毒的遗传演化及分离毒株的致病性分析[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(9): 3121-3131.
[15]	许李锋, 贾晨宇, 陈福再, 方梦园, 刘孝丹, 陈吉龙, 李训良. 1株鸡滑液囊支原体的分离鉴定与全基因组分析[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(8): 2663-2676.

14株北京地区犬细小病毒分离毒株的VP2、NS1基因序列分析

Sequence Analysis of the Complete VP2 and NS1 Genes of 14 Canine Parvovirus Isolates in Beijing

RichHTML

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献 13

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价