北京油鸡肌肉和卵巢组织基因组DNA甲基化状态检测与分析

doi:10.11843/j.issn.0366-6964.2014.11.007

畜牧兽医学报 ›› 2014, Vol. 45 ›› Issue (11): 1784-1792.doi: 10.11843/j.issn.0366-6964.2014.11.007

北京油鸡肌肉和卵巢组织基因组DNA甲基化状态检测与分析

李金龙^1#,唐韶青^2#,赵萌¹,王海潮¹,徐青^1*

(1.北京交通大学生命科学与生物工程研究院，北京 100044； 2.北京市畜牧兽医总站，北京 100029)

收稿日期:2014-03-27 出版日期:2014-11-23 发布日期:2014-11-24
通讯作者: 徐青，副教授，E-mail：qingxu@bjtu.edu.cn
作者简介:李金龙(1988-)，男，满族，河北承德人，硕士生，主要从事分子遗传学研究，E-mail：lijinlong880827@163.com；唐韶青，博士，主要从事动物分子数量遗传学研究，E-mail：tangshaoqingcau@163.com。李金龙和唐韶青为共同第一作者
基金资助:
北京市自然科学基金资助项目(6112018)；中央高校基本科研业务费专项基金资助项目(2012JBE003)；国家自然科学基金青年基金资助项目(31101711)

Detection of DNA Methylation in Whole Genomes of Muscle and Ovary Tissues of Beijing You Chicken

LI Jin-long^1#，TANG Shao-qing^2#，ZHAO Meng¹，WANG Hai-chao¹，XU Qing^1*

(1.Institute of Life Science and Biotechnology，Beijing Jiaotong University,Beijing 100044,China;2.Beijing Animal Husbandry Station,Beijing 100029，China)

Received:2014-03-27 Online:2014-11-23 Published:2014-11-24

摘要/Abstract

摘要：

以17周龄北京油鸡为试验材料，应用甲基化敏感扩增多态性(Methylation sensitive amplified polymorphism，MSAP)方法检测肌肉和卵巢组织的基因组DNA甲基化模式和程度，进而分析肌肉和卵巢组织基因组DNA甲基化的差异。结果表明，应用12对选择性扩增引物共产生4 297条清晰可辨的扩增条带，平均每个个体每对引物组合可获得10～20个条带。在检测的个体中，肌肉组织的甲基化水平为35.86%，卵巢组织为31.50%，2种组织的甲基化水平差异显著(P<0.01)。北京油鸡体重与肌肉组织的甲基化水平存在极显著负相关(P<0.01)，与卵巢组织的甲基化水平的相关性未达到显著水平(P>0.05)。分离鉴定了5个组织特异性的甲基化片段。结果显示，北京油鸡肌肉和卵巢组织的基因组DNA的甲基化状态存在差异，而肌肉组织的甲基化状态对北京油鸡的体重具有重要作用。

关键词: 甲基化, 组织, 体重, 北京油鸡, MSAP

Abstract:

The DNA methylation extent and pattern was assessed in genomes in muscle and ovary tissues from the 17-week-old Beijing You chicken using a methylation sensitive amplified polymorphism (MSAP) approach in this study.We analyzed different DNA methylation levels in different tissues.A total of 4 297 clear bands were obtained using 12 pairs of selective amplification primers，about 10-20 bands per sample with a pair of primers.The degree of methylation was approximate 35.86% in muscle and 31.50% in ovary in Beijing You chickens，and a significant difference was found between 2 tissues at the methylation levels (P<0.01).Further analysis indicated that no significant relationship was detected in ovary tissue between the methylation levels and individual weight (P>0.05)，but strongly negative correlation was depicted in muscle tissue (P<0.01).Five tissue-specific MSAP fragments were isolated and verified.Overall results reveal that there is a significant difference at the methylation levels between muscle and ovary tissues，and the methylated state of muscle tissue may play an important role in the body weight of Beijing You chicken.

Key words: methylation, tissues, weight, Beijing You chicken, MSAP

中图分类号:

S831.2
Q75

李金龙,唐韶青,赵萌,王海潮,徐青. 北京油鸡肌肉和卵巢组织基因组DNA甲基化状态检测与分析[J]. 畜牧兽医学报, 2014, 45(11): 1784-1792.

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北京油鸡肌肉和卵巢组织基因组DNA甲基化状态检测与分析

Detection of DNA Methylation in Whole Genomes of Muscle and Ovary Tissues of Beijing You Chicken

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