基于COⅠ基因序列对我国部分巴贝斯虫分类的研究

doi:10.11843/j.issn.0366-6964.2016.06.028

畜牧兽医学报 ›› 2016, Vol. 47 ›› Issue (6): 1293-1298.doi: 10.11843/j.issn.0366-6964.2016.06.028

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基于COⅠ基因序列对我国部分巴贝斯虫分类的研究

苟惠天¹，薛慧文¹，殷宏²，孙晓林^1*，罗建勋^2*

（1甘肃农业大学动物医学院，兰州 730070；2中国农业科学院兰州兽医研究所，兰州 730046）

收稿日期:2015-11-16 出版日期:2016-06-23 发布日期:2016-06-23
通讯作者: 罗建勋，男，研究员，E-mail：vectorparasit@126.com；孙晓林，男，教授，E-mail：sunxl@gsau.edu.cn
作者简介:苟惠天（1980-），甘肃临洮人，讲师，博士，主要从事兽医公共卫生研究工作，E-mail：gouht@gsau.edu.cn
基金资助:
国家自然科学基金（31560700）；甘肃省自然科学基金（145RJZA172）；兰州市科技创新人才计划（2014-2-11）；甘肃农业大学盛彤笙创新基金（GSAU-STS-1422）

Toxonomic Study of Some Babesia spp.Based on COⅠ Gene in China

GOU Hui-tian¹，XUE Hui-wen¹，YIN Hong²，SUN Xiao-lin ^1* ，LUO Jian-xun ^2*

（1．College of Veterinary Medicine，Gansu Agricultural University，Lanzhou 730070，China；2．Lanzhou Veterinary Research Institute of Chinese Academy of Agricultural Science，Lanzhou 730046，China)

Received:2015-11-16 Online:2016-06-23 Published:2016-06-23

摘要/Abstract

摘要：

为了确定巴贝斯虫中国分离株的分类地位，对我国报道的7种巴贝斯虫11个地方分离株的COⅠ基因序列进行测定；并与GenBank中其他巴贝斯虫COⅠ和相应18S rRNA基因序列分别构建系统发生树，比较基于不同基因的分类结果。结果显示：11株巴贝斯虫的COⅠ基因大小在935~999 bp，与18S rRNA基因比较，COⅠ基因序列含有较多的变异位点及简约信息位点；基于两个基因的系统发育树，对于牛巴贝斯虫的分类结果基本一致。但也存在如下差异：18S rRNA无法将泰勒虫与巴贝斯虫进行区分，而COⅠ基因可明显区分；羊巴贝斯虫新疆未定种的分类地位在基于COⅠ基因的分类中更具合理性。来源于COⅠ和18S rRNA的信息都说明我国莫氏巴贝斯虫的不同地方株间可能存在亚种关系。该研究为巴贝斯虫的分子分类提供了候选基因。

Abstract:

In order to clarify the taxonomic status of Babesia spp，the COⅠgene were sequenced from 11 isolates of 7 species reported in China；The phylogenetic tree were constructed using COⅠand 18S rRNA sequences downloaded from GenBank and this study，and also the two phylogenetic trees were compared.As result shown，the length of COⅠgene was 935-999 bp，and the COⅠgene had more variation and informative sites than 18S rRNA.The taxonomic status of bovis Babesia spp.based on COⅠand 18S rRNA shared high similarity.However，there were also some differences from two phylogenetic trees.Such as，the COⅠgene can differentiate Babesia spp and Theileria spp clearly.To 18S rRNA，it was more difficult.The taxonomic status based on COⅠgene of Babesia sp.from Xinjiang was more reasonable.The information of two phylogenetic tree suggested that the Babesia motasi isolated from different region may represent different subspecies.This study supported the candidate gene of molecular taxonomy of Babesia spp.

中图分类号:

S852.72

苟惠天，薛慧文，殷宏，孙晓林，罗建勋. 基于COⅠ基因序列对我国部分巴贝斯虫分类的研究[J]. 畜牧兽医学报, 2016, 47(6): 1293-1298.

GOU Hui-tian，XUE Hui-wen，YIN Hong，SUN Xiao-lin，LUO Jian-xun. Toxonomic Study of Some Babesia spp.Based on COⅠ Gene in China[J]. ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA, 2016, 47(6): 1293-1298.

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参考文献

［1］TELFORD S R 3rd，SPIELMAN A．Reservoir competence of white-footed mice for Babesia microti［J］．J Med Entomol，1993，30(1)：223-227．
［2］LUO J，YIN H，GUAN G，et al．A comparison of small-subunit ribosomal RNA gene sequence of bovine Babesia species transmitted by Haemaphysalis spp. in China［J］．Parasitol Res，2005，95(2)：145-149．
［3］YIN H，LU W，LUO J，et al．Experiments on the transmission of Babesia major and Babesia bigemina by Haemaphysalis punctata［J］．Vet Parasitol，1996，67(1-2)：89-98．
［4］GUAN G Q，YIN H，LUO J X，et al．Transmission of Babesia sp to sheep with field-collected Haemaphysalis qinghaiensis［J］．Parasitol Res，2002，88(13 Suppl 1)：22-24．
［5］NIU Q，LUO J，GUAN G，et al．Differentiation of two ovine Babesia based on the ribosomal DNA internal transcribed spacer (ITS) sequences［J］．Exp Parasitol，2009，121(1)：64-68．
［6］AHMED J S，LUO J，SCHNITTGER L，et al．Phylogenetic position of small-ruminant infecting piroplasms［J］．Ann N Y Acad Sci，2006，1081：498-504．
［7］LIU J，YIN H，LIU G，et al．Discrimination of Babesia major and Babesia ovata based on ITS1-5.8S-ITS2 region sequences of rRNA gene［J］．Parasitol Res，2008，102(4)：709-713．
［8］LIU A，GUAN G，LIU Z，et al．Detecting and differentiating Theileria sergenti and Theileria sinensis in cattle and yaks by PCR based on major piroplasm surface protein (MPSP)［J］．Exp Parasitol，2010，126(4)：476-481．
［9］MATZEN DA SILVA J，CREER S，DOS SANTOS A，et al．Systematic and evolutionary insights derived from mtDNA COI barcode diversity in the decapoda (Crustacea：Malacostraca)［J］．PLoS Ｏne，2011，6(5)：e19449．
［10］DERYCKE S，VANAVERBEKE J，RIGAUX A，et al．Exploring the use of cytochrome oxidase c subunit 1 (COI) for DNA barcoding of free-living marine nematodes［J］．PLoS One，2010，5(10)：e13716．
［11］ARMSTRONG P M，KATAVOLOS P，CAPORALE D A，et al．Diversity of Babesia infecting deer ticks (Ixodes dammini)［J］．Am J Trop Med Hyg，1998，58(6)：739-742．
［12］TAMURA K，DUDLEY J，NEI M，et al．MEGA4：molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) software version 4.0［J］．Mol Biol Evol，2007，24(8)：1596-1599．
［13］SWOFFORD D．PAUP 4.0 b10：Phylogenetic analysis using parsimony［M］.Sunderland，MA，USA：Sinauer Associates，2002.
［14］RONQUIST F，HUELSENBECK J P．MrBayes 3：Bayesian phylogenetic inference under mixed models［J］．Bioinformatics，2003，19(12)：1572-1574．
［15］MEDINA M，COLLINS A G，SILBERMAN J D，et al．Evaluating hypotheses of basal animal phylogeny using complete sequences of large and small subunit rRNA［J］．Proc Natl Acad Sci U S A，2001，98(17)：9707-9712．
［16］UILENBERG G．Babesia—a historical overview［J］．Vet Parasitol，2006，138(1-2)：3-10．
［17］BAI Q，LIU G，LIU D，et al．Isolation and preliminary characterization of a large Babesia sp.from sheep and goats in the eastern part of Gansu Province，China［J］．Parasitol Res，2002，88(13 Suppl 1)：S16-S21．
［18］LIU A H，YIN H，GUAN G Q，et al．At least two genetically distinct large Babesia species infective to sheep and goats in China［J］．Vet Parasitol，2007，147(3-4)：246-251．
［19］GUAN G，MOREAU E，LIU J，et al．Babesia sp.BQ1 (Lintan)：Molecular evidence of experimental transmission to sheep by Haemaphysalis qinghaiensis and Haemaphysalis longicornis［J］．Parasitol Int，2010，59(2)：265-267．

[1]	肖洁, 罗跃军, 陈浩, 蒲家艳, 何维, 熊常明, 郝哥, 任永军, 杨光友. 兔斯氏艾美耳球虫、肠艾美耳球虫和大型艾美耳球虫PCR检测靶标的筛选与单一、多重直接PCR检测方法的建立[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(10): 4327-4337.
[2]	郑若愚, 肖洁, 白鑫, 陈浩, 蒲家艳, 任永军, 杨光友. 大型艾美耳球虫重组蛋白GAPDH对兔的免疫保护效果评价[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(10): 4338-4349.
[3]	郑若愚, 任永军, 肖洁, 白鑫, 蒲家艳, 陈浩, 杨光友. 斯氏艾美耳球虫3-磷酸甘油醛脱氢酶重组蛋白对兔的免疫保护效果评价[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(6): 2581-2595.
[4]	王礼跃, 冯茜茜, 蔡为民, 刘丹丹, 候照峰, 康喜龙, 张知之, 范雪莲, 朱玉, 许金俊, 潘志明, 陶建平. 鸡毒害艾美耳球虫ApiAP2转录因子的克隆、表达与虫体内定位[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(12): 4379-4388.
[5]	赵保才, 赵帅阳, 关贵全, 罗建勋, 曹天行, 张志刚, 石苗, 刘军龙, 赵洪喜. 基于转录组数据分析环形泰勒虫对诱导宿主细胞转化相关基因的影响[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(12): 4398-4409.
[6]	尹艳玲, 黄爽, 姚倩, 吴江平, 郭浩晨, 杨新, 宋军科, 赵光辉. 环状RNA ciRS-7靶向miR-219a-5p影响微小隐孢子虫体外增殖的机制[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(11): 3989-3999.
[7]	张义伟, 苏紫薇, 李其龙, 陈冉, 姜宁. 伯氏疟原虫ANKA株感染小鼠的T细胞、NK细胞及细胞因子变化[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(11): 4008-4018.
[8]	郑晓楠, 李婷婷, 王金磊, 郑文斌, 朱兴全. 弓形虫致密颗粒蛋白的生物学功能研究进展[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(10): 3345-3357.
[9]	王沛, 王萌, 李婷婷, 郑晓楠, 梁勤立, 陈小庆. 弓形虫4个假定蛋白基因缺失株的构建及其基本生物功能学研究[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(10): 3598-3608.
[10]	肖克, 陈婷, 赵其平, 朱顺海, 董辉, 刘曼玉, 于钰, 黄兵, 韩红玉. 柔嫩艾美耳球虫含HD结构域蛋白特性和功能初步研究[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(8): 2608-2620.
[11]	伍雪梅, 杨新, 原亚杰, 尹艳玲, 赖鹏, 宋军科, 史怀平, 赵光辉. C5a/C5aR信号在微小隐孢子虫感染中的免疫调节作用研究[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(8): 2621-2632.
[12]	陈慧娴, 陈雅婕, 王先梅, 王丽芳, 刘群, 刘晶. 弓形虫和新孢子虫交叉反应抗原MIC7A对小鼠的免疫保护效力分析[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(7): 2300-2306.
[13]	郑雨昕, 张义伟, 姜宁. 恶性疟原虫ApiAP2蛋白质家族研究进展[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(5): 1354-1363.
[14]	叶状, 王乐乐, 汪飞燕, 刘悦, 彭月梅, 宿世杰, 候照峰, 许金俊, 陶建平, 刘丹丹. 毒害艾美耳球虫氧化还原酶EnOXIO1的原核表达与定位分析[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(5): 1553-1561.
[15]	焦宇洲, 杨欢欢, 卢垚, 史聪聪, 徐晓娟, 蔡旭旺. 屎肠球菌对感染柔嫩艾美耳球虫肉鸡生长性能和肠道屏障的影响[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(4): 1210-1219.

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