畜牧兽医学报 ›› 2009, Vol. 40 ›› Issue (8): 1157-1163.doi:
高智晟1,2,3,杨龙2 ,张冬杰2 ,刘娣2*
GAO ZhiSheng 1,2,3, YANG Long 2, ZHANG DongJie 2, LIU Di 2*
摘要: 为了进一步了解猪MEF2a基因的结构与功能,本研究采用生物信息学结合RTPCR的方法,克隆了猪的MEF2a基因,获得了它的2个变异体序列。结果表明,猪MEF2a variant 1基因cDNA长1 524 bp(EF576923),编码508个氨基酸,分子量为54.481 ku;variant 2基因cDNA长1 416 bp(EF576922),编码471个氨基酸,分子量为50.846 ku。MEF2a两个变异体的氨基酸序列同源性为86.79%,第1aa~77aa和第132aa~470aa完全一致,第78aa~131aa是高变区,variant2与variant1相比,在第224aa~258aa处存在34个氨基酸(102 bp)的缺失。利用Realtime PCR方法检测了MEF2a的表达。结果表明,MEF2a mRNA是一个广谱表达基因,在心、肝、胃、脾、肾、肺、大肠、小肠、背肌和腿肌中都能检测到,在腿肌中优势表达。MEF2a variant1与马和家鼠构成一个小类群,而variant 2与牛和人构成了另外一个小类群,推测MEF2a基因在进化过程中发生了较为明显的变异。