鹅固醇调节元件结合蛋白1基因的克隆及生物信息学分析

畜牧兽医学报 ›› 2008, Vol. 39 ›› Issue (7): 994-999.

鹅固醇调节元件结合蛋白1基因的克隆及生物信息学分析

韩春春, 王继文*

四川农业大学畜禽品种资源发掘与利用重点实验室，雅安 625014

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2008-07-23 发布日期:2008-07-23
通讯作者: 王继文

DNA Segment Cloning and Bioinformatics Analysis of SREBP-1 Gene in the Landes Goose

HAN Chun-chun, WANG Ji-wen*

Key Lab of Animal Genetic Resources, Sichuan Agricultural University, Ya’an 625014,China

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2008-07-23 Published:2008-07-23

摘要/Abstract

摘要： 从16周龄朗德鹅肝脏组织提取总RNA，采用反转录-多聚酶链式反应(RT-PCR)方法扩增出1条长约280 bp的cDNA片段。序列分析结果表明，扩增出的cDNA片段与固醇调节元件结合蛋白1(SREBP-1)基因有较高的同源性，并且该片段包含着1个bHLH功能区。同时该片段包含1个明显的亲水区和1个明显的疏水区，二级结构富含α-螺旋，这与其功能相符。

关键词: 朗德鹅, 固醇调节元件结合蛋白1基因, 生物信息学分析

Abstract: Total RNA from Landes goose liver of 16 weeks old was extracted.The cDNA segment about 282 bp of Langdes goose was amplified by the reverse transcription-polymerase chain reaction(RT-PCR)Sequence analysis showed that there is a high similarity between the fragment of cDNA and sterol regulatory element binding protein-1(SREBP-1) gene containing a bHLH function region. Meanwhile, the segment evidently has a hydrophilic region and a hydrophobic region, and the secondary structure richly contains αhelix, which accords with its function.

Key words: Landes goose, sterol regulatory element binding protein-1 gene, bioinformatics analysis

韩春春;王继文. 鹅固醇调节元件结合蛋白1基因的克隆及生物信息学分析[J]. 畜牧兽医学报, 2008, 39(7): 994-999.

HAN Chun-chun;WANG Ji-wen. DNA Segment Cloning and Bioinformatics Analysis of SREBP-1 Gene in the Landes Goose[J]. ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA, 2008, 39(7): 994-999.

[1]	赵学亮, 王姝懿, 孙柯, 苏倩, 王文龙, 刘春霞. 捻转血矛线虫阿苯达唑敏感株和耐药株比较转录组学分析[J]. 畜牧兽医学报, 2019, 50(9): 1940-1944.
[2]	陈瑞, 朱子凤, 黄坚, 杨晓农. 家兔矮小同源盒基因(Shox2)的克隆和表达分析[J]. 畜牧兽医学报, 2019, 50(1): 61-70.
[3]	陈瑞, 朱子凤, 黄坚, 杨晓农. 家兔矮小同源盒基因(Shox2)的克隆和表达分析[J]. 畜牧兽医学报, 2019, 50(1): 61-70.
[4]	王文龙, 赵学亮, 孙柯, 冯陈晨, 白丽艳, 王姝懿, 王梦雅, 刘春霞. 斯氏副柔线虫CAMK/TSSK蛋白激酶基因的克隆及其蛋白质结构与抗原表位预测分析[J]. 畜牧兽医学报, 2018, 49(3): 644-651.
[5]	王文龙, 赵学亮, 孙柯, 冯陈晨, 白丽艳, 王姝懿, 王梦雅, 刘春霞. 斯氏副柔线虫CAMK/TSSK蛋白激酶基因的克隆及其蛋白质结构与抗原表位预测分析[J]. 畜牧兽医学报, 2018, 49(3): 644-651.
[6]	贾志鹏, 彭小彬, 罗查干, 哈斯苏荣. 双峰驼CYP2J cDNA全长克隆、序列信息及组织表达分析[J]. 畜牧兽医学报, 2018, 49(10): 2133-2144.
[7]	贾志鹏, 彭小彬, 罗查干, 哈斯苏荣. 双峰驼CYP2J cDNA全长克隆、序列信息及组织表达分析[J]. 畜牧兽医学报, 2018, 49(10): 2133-2144.
[8]	杨振，李彦莹，罗俊，张涛，刘贺贺，蒲梅，肖香君，任艳霖. 鸭Ccna1启动子克隆、序列分析及在鸭骨骼肌中的发育性表达[J]. 畜牧兽医学报, 2017, 48(2): 377-384.
[9]	杨振，李彦莹，罗俊，张涛，刘贺贺，蒲梅，肖香君，任艳霖. 鸭Ccna1启动子克隆、序列分析及在鸭骨骼肌中的发育性表达[J]. 畜牧兽医学报, 2017, 48(2): 377-384.
[10]	张雯，许厚强，陈伟，陈祥，桓聪聪，夏丹，周迪. 关岭牛MyoDI基因启动子上转录因子结合位点的筛选[J]. 畜牧兽医学报, 2015, 46(7): 1259-1267.
[11]	张雯，许厚强，陈伟，陈祥，桓聪聪，夏丹，周迪. 关岭牛MyoDI基因启动子上转录因子结合位点的筛选[J]. 畜牧兽医学报, 2015, 46(7): 1259-1267.
[12]	张春香，郭云雁，白元生，杨子森，张国林，焦光月，任有蛇. 绵羊GPx5基因克隆、生物信息学分析及表达特性的研究[J]. 畜牧兽医学报, 2014, 45(7): 1075-1083.
[13]	张春香，郭云雁，白元生，杨子森，张国林，焦光月，任有蛇. 绵羊GPx5基因克隆、生物信息学分析及表达特性的研究[J]. 畜牧兽医学报, 2014, 45(7): 1075-1083.
[14]	金梅，张丽丽，曲杨乐，朴君，李秀娜，王宜萌，朴敬爱. 辽宁新品系绒山羊GMPR2基因的生物学功能研究[J]. 畜牧兽医学报, 2013, 44(11): 1706-1716.
[15]	金梅，张丽丽，曲杨乐，朴君，李秀娜，王宜萌，朴敬爱. 辽宁新品系绒山羊GMPR2基因的生物学功能研究[J]. 畜牧兽医学报, 2013, 44(11): 1706-1716.