畜牧兽医学报 ›› 2015, Vol. 46 ›› Issue (12): 2161-2168.doi: 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.12.006
刘雪雪1,阿地力江•卡德尔1,董坤哲1,王月月1,潘建飞2,浦亚斌1,何晓红1,马月辉1,蒋琳1*
LIU Xue-xue1,ADLIJIANG Halik1,DONG Kun-zhe1,WANG Yue-yue1,PAN Jian-fei2,PU Ya-bin1,HE Xiao-hong1,MA Yue-hui1,JIANG Lin1*
摘要:
旨在对德保矮马(Debao pony)X染色体的选择信号进行筛选。本研究利用Illumina公司开发的马芯片Equine 65K SNP BeadChip,对德保矮马、伊犁马、蒙古马进行X染色体扫描,获得2 339个SNPs位点。通过群体分化系数FST法和XP-EHH两种不同的方法,分别以伊犁马和蒙古马为对照群体对德保矮马进行X染色体选择信号检测。结果,筛选到两个受到较强选择区域4.0~39.9和87.1~123.5 Mb,包含64个“离群位点”。通过基因注释筛选到PHEX、BCOR、PNPLA4和GPC3等与生长和骨骼发育相关的基因。研究结果发现,德保矮马的选育过程中X染色体很多与生长相关的基因受到了强烈的选择,其中部分在马中未见报道,可以作为研究矮小性状的重要候选基因。
中图分类号: