H6N6亚型禽流感病毒广东分离株分子遗传演化分析

doi:10.11843/j.issn.0366-6964.2014.06.018

畜牧兽医学报 ›› 2014, Vol. 45 ›› Issue (6): 989-996.doi: 10.11843/j.issn.0366-6964.2014.06.018

H6N6亚型禽流感病毒广东分离株分子遗传演化分析

张烁¹，林宏文²，袁润余¹，宋亚芬¹，崔进¹，龚浪¹，瞿孝云¹，韩翡¹，吴晓薇³，徐成刚¹，廖明^1*，焦培荣^1*

(1.华南农业大学兽医学院，人兽共患病防控制剂国家地方联合工程实验室，农业部兽用疫苗创制重点实验室，广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室，广州 510642；2.内蒙古自治区通辽市扎鲁特旗农牧业局，通辽 029100；3.广东省检验检疫局，广州 510623)

收稿日期:2013-11-08 出版日期:2014-06-23 发布日期:2014-06-23
通讯作者: 焦培荣，副研究员，硕士生导师，E-mail：prjiao@yahoo.com；廖明，教授，博士生导师，Tel：020-85280240，E-mail：mliao@scau.edu.cn
作者简介:张烁(1989-)，安徽亳州人，硕士生，主要从事动物传染病研究，E-mail：zhangshuovet@126.com
基金资助:
国家肉鸡产业技术体系项目（nycytx-42-G3-03）；广东省自然科学基金项目（10251064201000004；10151064201000021）；广东省科技计划项目（2010B020307005；2012B020306003）；广东检验检疫局科技计划项目（2011GDK46）；广州市科技计划项目（2013J4500030；201300000037）

Phylogenetic Analysis of H6N6 Subtype Avian Influenza Virus from Guangdong

ZHANG Shuo¹，LIN Hong-wen²，YUAN Run-yu¹，SONG Ya-fen¹，CUI Jin¹，GONG Lang¹，QU Xiao-yun¹，HAN Fei¹，WU Xiao-wei³，XU Cheng-gang¹，LIAO Ming^1*，JIAO Pei-rong^1*

(1.National and Regional Joint Engineering Laboratory for Medicament of Zoonoses Prevention and Control，MOA Key Laboratory for Animal Vaccine Development，Key Lab of Zoonoses Control and Prevention of Guangdong，College of Veterinary Medicine，South China Agricultural University，Guangzhou 510642， China; 2.Agriculture and Husbandry Bureau of Zhalute County，Tongliao 029100， China; 3.Guangdong Entry-exit Inspection and Quarantine Bureau，Guangzhou 510623， China)

Received:2013-11-08 Online:2014-06-23 Published:2014-06-23

摘要/Abstract

摘要：

2010年至2011年在中国广东地区活禽交易市场进行流行病学调查时，在鸭咽和泄殖腔拭子中分离到2株H6N6亚型禽流感病毒，分别命名为A/Duck/Guangdong/C45/2010(H6N6)、A/Duck/Guangdong/C120/2011(H6N6)。应用RT-PCR分别对2株毒株的8个基因片段进行了克隆、测序与分析，结果表明：2毒株的HA裂解位点附近的氨基酸序列为P-Q-I-E-T-R-G，只有1个碱性氨基酸，符合低致病性禽流感病毒HA裂解位点附近的氨基酸序列特征；与2毒株HA基因相似性最高的毒株为A/Duck/Guangxi/GXd-5/2010(H6N1)，与NA基因相似性最高的毒株分别为A/Duck/Fujian/3242/2007(H6N6)和A/Duck/Fujian/6159/2007(H6N6)。全基因组分子遗传演化分析表明，2毒株的8个基因片段均属于欧亚谱系的禽源演化分支；但HA基因属于ST2853-like分支，NP基因属于HN573-like分支，PB2、PB1、PA、M和NS基因属于ST339-like分支，说明本研究中的2株病毒为不同基因群间基因交换的重组病毒。因此，有必要加强H6亚型禽流感病毒流行病学调查以便及时关注其遗传变异与致病性进化，为中国禽流感的预防与控制提供数据支持和理论指导。

Abstract:

Two H6N6 subtype avian influenza viruses (AIV)，A/Duck/Guangdong/C45/2010(H6N6) and A/Duck/Guangdong/C120/2011(H6N6)，were isolated from the live-poultry markets of Guangdong during 2010 to 2011.The sequence analysis of the hemagglutinin (HA) gene showed that the isolates were categorized as low pathogenic AIV，with the typical HA cleavage site of P-Q-I-E-T-R-G.The HA gene of the two isolates was closely related to that of A/Duck/Guangxi/GXd-5/2010(H6N1).The NA genes of the two isolates were closely related to that of A/Duck/Fujian/3242/2007(H6N6) and A/Duck/Fujian/6159/2007(H6N6)，respectively.The phylogenic analysis indicated that the eight genes of the two isolates belonged to the Eurasian avian lineage.The HA and NP genes of them belonged to ST2853-like lineage and HN573-like lineage，respectively.However，the other genes of them belonged to ST339-like lineage.Those indicated that the two isolates were recombinant viruses resulted from different genotype viruses.Therefore，we should focus on studying the pathogenic evolution and genetic variation of H6N6 subtype AIV to prevent and control the AIV.

中图分类号:

S852.659.5

张烁，林宏文，袁润余，宋亚芬，崔进，龚浪，瞿孝云，韩翡，吴晓薇，徐成刚，廖明，焦培荣. H6N6亚型禽流感病毒广东分离株分子遗传演化分析[J]. 畜牧兽医学报, 2014, 45(6): 989-996.

ZHANG Shuo，LIN Hong-wen，YUAN Run-yu，SONG Ya-fen，CUI Jin，GONG Lang，QU Xiao-yun，HAN Fei，WU Xiao-wei，XU Cheng-gang，LIAO Ming，JIAO Pei-rong. Phylogenetic Analysis of H6N6 Subtype Avian Influenza Virus from Guangdong[J]. ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA, 2014, 45(6): 989-996.

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Phylogenetic Analysis of H6N6 Subtype Avian Influenza Virus from Guangdong

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